Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOT1P17174 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOT1P17174 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOT1P17174 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOT1P17174 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOT1P17174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOT1P17174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOT1P17174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOT1P17174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOT1P17174 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOT1P17174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOT1P17174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOT1P17174 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOT1P17174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOT1P17174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOT1P17174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOT1P17174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOT1P17174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOT1P17174 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOT1P17174 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOT1P17174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOT1P17174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOT1P17174 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOT1P17174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOT1P17174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOT1P17174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOT1P17174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOT1P17174 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOT1P17174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOT1P17174 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOT1P17174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOT1P17174 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOT1P17174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOT1P17174 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOT1P17174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOT1P17174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GOT1P17174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOT1P17174 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOT1P17174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOT1P17174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOT1P17174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOT1P17174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOT1P17174 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOT1P17174 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOT1P17174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOT1P17174 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOT1P17174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOT1P17174 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOT1P17174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOT1P17174 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOT1P17174 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOT1P17174 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOT1P17174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOT1P17174 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOT1P17174 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GOT1P17174 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GOT1P17174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOT1P17174 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOT1P17174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOT1P17174 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOT1P17174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOT1P17174 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOT1P17174 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOT1P17174 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOT1P17174 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOT1P17174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOT1P17174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOT1P17174 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOT1P17174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms