Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC1P15941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC1P15941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUC1P15941 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC1P15941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC1P15941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MUC1P15941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC1P15941 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC1P15941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MUC1P15941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MUC1P15941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC1P15941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MUC1P15941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MUC1P15941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MUC1P15941 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MUC1P15941 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MUC1P15941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC1P15941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC1P15941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MUC1P15941 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC1P15941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC1P15941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC1P15941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC1P15941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MUC1P15941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC1P15941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC1P15941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC1P15941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC1P15941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MUC1P15941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC1P15941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MUC1P15941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC1P15941 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC1P15941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MUC1P15941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MUC1P15941 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC1P15941 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MUC1P15941 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC1P15941 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC1P15941 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MUC1P15941 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC1P15941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC1P15941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC1P15941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC1P15941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC1P15941 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC1P15941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC1P15941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC1P15941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC1P15941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC1P15941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC1P15941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC1P15941 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC1P15941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC1P15941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC1P15941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC1P15941 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC1P15941 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC1P15941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC1P15941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC1P15941 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC1P15941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC1P15941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC1P15941 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC1P15941 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC1P15941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC1P15941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC1P15941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC1P15941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC1P15941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MUC1P15941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MUC1P15941 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms