Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSF2RAP15509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSF2RAP15509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSF2RAP15509 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CSF2RAP15509 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSF2RAP15509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSF2RAP15509 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF2RAP15509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms