Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPBP14678 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPBP14678 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPBP14678 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPBP14678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPBP14678 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms