Protein–RNA interactions for Protein: P13807

GYS1, Glycogen [starch] synthase, muscle, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS1P13807 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GYS1P13807 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GYS1P13807 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GYS1P13807 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GYS1P13807 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GYS1P13807 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GYS1P13807 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GYS1P13807 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GYS1P13807 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GYS1P13807 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GYS1P13807 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GYS1P13807 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GYS1P13807 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GYS1P13807 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GYS1P13807 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GYS1P13807 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GYS1P13807 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GYS1P13807 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GYS1P13807 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GYS1P13807 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GYS1P13807 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
GYS1P13807 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GYS1P13807 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GYS1P13807 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GYS1P13807 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GYS1P13807 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GYS1P13807 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GYS1P13807 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GYS1P13807 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GYS1P13807 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GYS1P13807 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GYS1P13807 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GYS1P13807 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GYS1P13807 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GYS1P13807 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GYS1P13807 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GYS1P13807 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GYS1P13807 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GYS1P13807 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GYS1P13807 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GYS1P13807 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GYS1P13807 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GYS1P13807 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GYS1P13807 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GYS1P13807 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GYS1P13807 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GYS1P13807 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GYS1P13807 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GYS1P13807 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GYS1P13807 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GYS1P13807 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GYS1P13807 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GYS1P13807 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GYS1P13807 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GYS1P13807 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GYS1P13807 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GYS1P13807 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GYS1P13807 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GYS1P13807 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GYS1P13807 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GYS1P13807 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GYS1P13807 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GYS1P13807 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GYS1P13807 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GYS1P13807 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GYS1P13807 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GYS1P13807 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GYS1P13807 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GYS1P13807 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GYS1P13807 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GYS1P13807 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GYS1P13807 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GYS1P13807 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GYS1P13807 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GYS1P13807 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
GYS1P13807 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GYS1P13807 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GYS1P13807 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GYS1P13807 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GYS1P13807 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GYS1P13807 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GYS1P13807 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GYS1P13807 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GYS1P13807 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GYS1P13807 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GYS1P13807 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GYS1P13807 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GYS1P13807 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
GYS1P13807 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GYS1P13807 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GYS1P13807 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GYS1P13807 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms