Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT13P13646 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT13P13646 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT13P13646 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT13P13646 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT13P13646 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT13P13646 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT13P13646 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT13P13646 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT13P13646 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT13P13646 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KRT13P13646 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT13P13646 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT13P13646 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT13P13646 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT13P13646 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT13P13646 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT13P13646 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT13P13646 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT13P13646 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT13P13646 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT13P13646 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT13P13646 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT13P13646 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT13P13646 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT13P13646 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT13P13646 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT13P13646 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT13P13646 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT13P13646 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT13P13646 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT13P13646 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT13P13646 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT13P13646 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT13P13646 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT13P13646 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT13P13646 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT13P13646 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT13P13646 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT13P13646 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT13P13646 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT13P13646 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT13P13646 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT13P13646 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT13P13646 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT13P13646 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT13P13646 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT13P13646 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT13P13646 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT13P13646 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT13P13646 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT13P13646 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT13P13646 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT13P13646 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT13P13646 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT13P13646 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT13P13646 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT13P13646 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT13P13646 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT13P13646 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT13P13646 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT13P13646 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT13P13646 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT13P13646 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT13P13646 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT13P13646 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT13P13646 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT13P13646 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT13P13646 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT13P13646 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT13P13646 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT13P13646 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT13P13646 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms