Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARAP10276 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARAP10276 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARAP10276 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RARAP10276 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARAP10276 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RARAP10276 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RARAP10276 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RARAP10276 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARAP10276 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RARAP10276 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARAP10276 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARAP10276 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARAP10276 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARAP10276 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARAP10276 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARAP10276 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARAP10276 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARAP10276 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARAP10276 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARAP10276 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARAP10276 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARAP10276 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARAP10276 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARAP10276 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARAP10276 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARAP10276 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARAP10276 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARAP10276 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARAP10276 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARAP10276 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARAP10276 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARAP10276 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARAP10276 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARAP10276 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARAP10276 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RARAP10276 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARAP10276 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RARAP10276 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARAP10276 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARAP10276 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARAP10276 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARAP10276 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARAP10276 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARAP10276 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARAP10276 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARAP10276 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARAP10276 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARAP10276 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARAP10276 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARAP10276 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARAP10276 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARAP10276 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARAP10276 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RARAP10276 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARAP10276 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARAP10276 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARAP10276 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARAP10276 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARAP10276 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARAP10276 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARAP10276 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARAP10276 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARAP10276 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RARAP10276 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARAP10276 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARAP10276 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARAP10276 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARAP10276 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARAP10276 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARAP10276 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARAP10276 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RARAP10276 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARAP10276 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARAP10276 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARAP10276 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARAP10276 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARAP10276 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARAP10276 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RARAP10276 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARAP10276 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARAP10276 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARAP10276 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARAP10276 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms