Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPN1MW3P0DN78 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1MW3P0DN78 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1MW3P0DN78 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN1MW3P0DN78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN1MW3P0DN78 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms