Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P0DMU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P0DMU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P0DMU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P0DMU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P0DMU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P0DMU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P0DMU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P0DMU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P0DMU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P0DMU3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P0DMU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P0DMU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P0DMU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P0DMU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P0DMU3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P0DMU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P0DMU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P0DMU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P0DMU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P0DMU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
P0DMU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P0DMU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P0DMU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P0DMU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P0DMU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P0DMU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P0DMU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P0DMU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P0DMU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P0DMU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P0DMU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P0DMU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P0DMU3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P0DMU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P0DMU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P0DMU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P0DMU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P0DMU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P0DMU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P0DMU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P0DMU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
P0DMU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P0DMU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P0DMU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
P0DMU3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
P0DMU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
P0DMU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P0DMU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P0DMU3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P0DMU3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
P0DMU3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
P0DMU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P0DMU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P0DMU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P0DMU3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P0DMU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P0DMU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P0DMU3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P0DMU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P0DMU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P0DMU3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P0DMU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P0DMU3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P0DMU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P0DMU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P0DMU3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P0DMU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P0DMU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P0DMU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms