Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBK2P0C263 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK2P0C263 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SBK2P0C263 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SBK2P0C263 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK2P0C263 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SBK2P0C263 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK2P0C263 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK2P0C263 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SBK2P0C263 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms