Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPIP09923 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPIP09923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALPIP09923 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALPIP09923 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALPIP09923 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPIP09923 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPIP09923 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPIP09923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPIP09923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALPIP09923 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPIP09923 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALPIP09923 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPIP09923 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPIP09923 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALPIP09923 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPIP09923 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALPIP09923 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPIP09923 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALPIP09923 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPIP09923 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALPIP09923 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPIP09923 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPIP09923 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALPIP09923 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALPIP09923 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPIP09923 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPIP09923 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPIP09923 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ALPIP09923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALPIP09923 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPIP09923 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPIP09923 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPIP09923 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALPIP09923 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALPIP09923 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALPIP09923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALPIP09923 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALPIP09923 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPIP09923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPIP09923 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALPIP09923 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPIP09923 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPIP09923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALPIP09923 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPIP09923 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPIP09923 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALPIP09923 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPIP09923 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPIP09923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPIP09923 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ALPIP09923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPIP09923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPIP09923 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALPIP09923 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALPIP09923 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALPIP09923 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALPIP09923 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALPIP09923 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPIP09923 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPIP09923 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPIP09923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPIP09923 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPIP09923 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPIP09923 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPIP09923 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPIP09923 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPIP09923 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPIP09923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPIP09923 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPIP09923 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPIP09923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPIP09923 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPIP09923 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPIP09923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALPIP09923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALPIP09923 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPIP09923 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPIP09923 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPIP09923 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPIP09923 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPIP09923 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPIP09923 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPIP09923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPIP09923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPIP09923 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPIP09923 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPIP09923 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms