Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
POLA1P09884 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
POLA1P09884 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
POLA1P09884 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
POLA1P09884 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
POLA1P09884 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
POLA1P09884 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
POLA1P09884 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
POLA1P09884 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
POLA1P09884 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.82
POLA1P09884 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
POLA1P09884 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
POLA1P09884 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
POLA1P09884 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
POLA1P09884 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
POLA1P09884 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
POLA1P09884 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
POLA1P09884 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
POLA1P09884 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
POLA1P09884 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
POLA1P09884 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
POLA1P09884 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
POLA1P09884 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
POLA1P09884 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
POLA1P09884 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
POLA1P09884 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
POLA1P09884 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
POLA1P09884 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
POLA1P09884 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
POLA1P09884 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
POLA1P09884 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
POLA1P09884 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
POLA1P09884 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
POLA1P09884 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
POLA1P09884 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
POLA1P09884 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
POLA1P09884 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
POLA1P09884 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
POLA1P09884 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
POLA1P09884 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
POLA1P09884 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
POLA1P09884 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
POLA1P09884 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
POLA1P09884 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
POLA1P09884 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
POLA1P09884 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
POLA1P09884 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
POLA1P09884 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
POLA1P09884 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
POLA1P09884 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
POLA1P09884 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
POLA1P09884 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
POLA1P09884 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
POLA1P09884 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
POLA1P09884 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
POLA1P09884 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
POLA1P09884 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
POLA1P09884 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
POLA1P09884 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
POLA1P09884 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
POLA1P09884 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
POLA1P09884 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
POLA1P09884 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
POLA1P09884 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
POLA1P09884 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
POLA1P09884 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
POLA1P09884 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
POLA1P09884 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
POLA1P09884 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
POLA1P09884 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
POLA1P09884 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
POLA1P09884 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
POLA1P09884 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
POLA1P09884 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
POLA1P09884 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
POLA1P09884 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
POLA1P09884 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
POLA1P09884 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
POLA1P09884 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
POLA1P09884 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
POLA1P09884 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
POLA1P09884 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
POLA1P09884 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
POLA1P09884 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
POLA1P09884 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
POLA1P09884 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
POLA1P09884 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
POLA1P09884 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
POLA1P09884 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
POLA1P09884 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
POLA1P09884 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms