Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFHP08603 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFHP08603 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFHP08603 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFHP08603 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFHP08603 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFHP08603 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFHP08603 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHP08603 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFHP08603 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFHP08603 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHP08603 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFHP08603 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFHP08603 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHP08603 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFHP08603 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHP08603 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHP08603 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHP08603 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFHP08603 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CFHP08603 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHP08603 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHP08603 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHP08603 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHP08603 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFHP08603 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHP08603 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFHP08603 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFHP08603 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFHP08603 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHP08603 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHP08603 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHP08603 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFHP08603 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHP08603 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHP08603 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHP08603 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFHP08603 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFHP08603 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFHP08603 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CFHP08603 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHP08603 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHP08603 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHP08603 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHP08603 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFHP08603 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFHP08603 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFHP08603 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFHP08603 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFHP08603 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFHP08603 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFHP08603 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFHP08603 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFHP08603 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFHP08603 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFHP08603 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFHP08603 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFHP08603 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFHP08603 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFHP08603 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFHP08603 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CFHP08603 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFHP08603 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFHP08603 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFHP08603 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFHP08603 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFHP08603 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFHP08603 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFHP08603 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFHP08603 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFHP08603 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFHP08603 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFHP08603 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFHP08603 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFHP08603 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFHP08603 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFHP08603 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFHP08603 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFHP08603 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFHP08603 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFHP08603 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFHP08603 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFHP08603 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFHP08603 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFHP08603 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFHP08603 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFHP08603 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFHP08603 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFHP08603 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFHP08603 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFHP08603 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFHP08603 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms