Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD55P08174 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD55P08174 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD55P08174 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD55P08174 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD55P08174 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD55P08174 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD55P08174 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD55P08174 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD55P08174 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD55P08174 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD55P08174 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD55P08174 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD55P08174 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD55P08174 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD55P08174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD55P08174 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD55P08174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD55P08174 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD55P08174 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD55P08174 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD55P08174 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD55P08174 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD55P08174 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD55P08174 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD55P08174 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD55P08174 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD55P08174 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD55P08174 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD55P08174 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD55P08174 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD55P08174 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD55P08174 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD55P08174 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD55P08174 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD55P08174 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD55P08174 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD55P08174 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD55P08174 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD55P08174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD55P08174 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD55P08174 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD55P08174 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD55P08174 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD55P08174 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD55P08174 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD55P08174 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD55P08174 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD55P08174 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD55P08174 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD55P08174 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD55P08174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD55P08174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD55P08174 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD55P08174 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD55P08174 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD55P08174 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD55P08174 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD55P08174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD55P08174 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD55P08174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD55P08174 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD55P08174 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD55P08174 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD55P08174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD55P08174 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD55P08174 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD55P08174 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD55P08174 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD55P08174 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD55P08174 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD55P08174 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD55P08174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD55P08174 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms