Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKMP06732 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKMP06732 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKMP06732 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKMP06732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKMP06732 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMP06732 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKMP06732 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKMP06732 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKMP06732 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CKMP06732 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMP06732 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMP06732 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMP06732 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMP06732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKMP06732 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKMP06732 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKMP06732 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKMP06732 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CKMP06732 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CKMP06732 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CKMP06732 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKMP06732 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMP06732 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMP06732 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKMP06732 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKMP06732 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKMP06732 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKMP06732 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKMP06732 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKMP06732 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKMP06732 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKMP06732 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKMP06732 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKMP06732 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CKMP06732 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKMP06732 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CKMP06732 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CKMP06732 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CKMP06732 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKMP06732 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKMP06732 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKMP06732 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CKMP06732 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKMP06732 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKMP06732 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKMP06732 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMP06732 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMP06732 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMP06732 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKMP06732 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKMP06732 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKMP06732 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKMP06732 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKMP06732 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CKMP06732 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKMP06732 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKMP06732 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKMP06732 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKMP06732 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKMP06732 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKMP06732 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKMP06732 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKMP06732 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKMP06732 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKMP06732 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKMP06732 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKMP06732 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CKMP06732 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CKMP06732 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CKMP06732 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKMP06732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKMP06732 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKMP06732 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKMP06732 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKMP06732 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKMP06732 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKMP06732 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKMP06732 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms