Protein–RNA interactions for Protein: P06729

CD2, T-cell surface antigen CD2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2P06729 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD2P06729 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD2P06729 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD2P06729 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD2P06729 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD2P06729 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD2P06729 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD2P06729 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD2P06729 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD2P06729 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2P06729 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD2P06729 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD2P06729 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2P06729 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2P06729 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD2P06729 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2P06729 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2P06729 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2P06729 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD2P06729 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2P06729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD2P06729 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2P06729 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD2P06729 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2P06729 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD2P06729 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD2P06729 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2P06729 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2P06729 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2P06729 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD2P06729 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2P06729 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2P06729 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2P06729 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD2P06729 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD2P06729 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD2P06729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD2P06729 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2P06729 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD2P06729 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2P06729 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2P06729 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD2P06729 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2P06729 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2P06729 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2P06729 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD2P06729 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD2P06729 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2P06729 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2P06729 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD2P06729 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2P06729 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD2P06729 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2P06729 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2P06729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD2P06729 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2P06729 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2P06729 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD2P06729 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2P06729 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD2P06729 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD2P06729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD2P06729 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD2P06729 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD2P06729 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD2P06729 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD2P06729 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD2P06729 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD2P06729 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD2P06729 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD2P06729 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD2P06729 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD2P06729 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD2P06729 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD2P06729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD2P06729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD2P06729 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD2P06729 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD2P06729 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD2P06729 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD2P06729 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD2P06729 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD2P06729 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD2P06729 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD2P06729 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD2P06729 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 603 ms