Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGRP06401 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGRP06401 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGRP06401 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PGRP06401 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGRP06401 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGRP06401 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGRP06401 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGRP06401 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGRP06401 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGRP06401 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGRP06401 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PGRP06401 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGRP06401 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGRP06401 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGRP06401 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGRP06401 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGRP06401 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGRP06401 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGRP06401 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGRP06401 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGRP06401 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGRP06401 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGRP06401 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGRP06401 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGRP06401 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGRP06401 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGRP06401 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGRP06401 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGRP06401 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGRP06401 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PGRP06401 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGRP06401 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGRP06401 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGRP06401 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGRP06401 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGRP06401 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGRP06401 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGRP06401 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGRP06401 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGRP06401 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGRP06401 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGRP06401 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGRP06401 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGRP06401 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGRP06401 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGRP06401 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGRP06401 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGRP06401 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGRP06401 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGRP06401 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGRP06401 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGRP06401 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGRP06401 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGRP06401 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGRP06401 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGRP06401 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGRP06401 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGRP06401 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGRP06401 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGRP06401 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGRP06401 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGRP06401 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGRP06401 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGRP06401 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGRP06401 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGRP06401 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGRP06401 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGRP06401 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGRP06401 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGRP06401 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGRP06401 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGRP06401 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGRP06401 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGRP06401 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGRP06401 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGRP06401 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGRP06401 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGRP06401 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGRP06401 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGRP06401 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGRP06401 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGRP06401 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms