Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCKP06239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCKP06239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCKP06239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCKP06239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCKP06239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCKP06239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCKP06239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LCKP06239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCKP06239 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCKP06239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LCKP06239 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCKP06239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCKP06239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCKP06239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCKP06239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCKP06239 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCKP06239 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCKP06239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCKP06239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCKP06239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCKP06239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCKP06239 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCKP06239 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCKP06239 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCKP06239 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCKP06239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
LCKP06239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCKP06239 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCKP06239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCKP06239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCKP06239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCKP06239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCKP06239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCKP06239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCKP06239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCKP06239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCKP06239 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCKP06239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCKP06239 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCKP06239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCKP06239 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCKP06239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCKP06239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCKP06239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCKP06239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCKP06239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms