Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TK1P04183 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TK1P04183 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TK1P04183 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TK1P04183 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TK1P04183 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TK1P04183 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TK1P04183 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TK1P04183 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TK1P04183 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TK1P04183 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TK1P04183 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TK1P04183 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TK1P04183 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TK1P04183 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TK1P04183 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TK1P04183 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TK1P04183 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TK1P04183 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TK1P04183 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TK1P04183 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TK1P04183 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TK1P04183 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TK1P04183 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TK1P04183 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TK1P04183 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TK1P04183 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TK1P04183 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TK1P04183 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TK1P04183 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TK1P04183 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TK1P04183 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TK1P04183 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TK1P04183 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TK1P04183 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TK1P04183 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TK1P04183 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TK1P04183 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TK1P04183 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TK1P04183 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TK1P04183 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK1P04183 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK1P04183 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK1P04183 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK1P04183 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK1P04183 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK1P04183 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK1P04183 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK1P04183 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK1P04183 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TK1P04183 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK1P04183 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK1P04183 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK1P04183 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK1P04183 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK1P04183 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK1P04183 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TK1P04183 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK1P04183 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK1P04183 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK1P04183 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK1P04183 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK1P04183 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK1P04183 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK1P04183 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK1P04183 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK1P04183 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK1P04183 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK1P04183 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TK1P04183 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TK1P04183 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TK1P04183 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TK1P04183 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TK1P04183 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TK1P04183 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TK1P04183 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TK1P04183 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TK1P04183 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TK1P04183 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TK1P04183 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TK1P04183 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TK1P04183 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TK1P04183 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.4 ms