Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OPN1SWP03999 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OPN1SWP03999 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OPN1SWP03999 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPN1SWP03999 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPN1SWP03999 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPN1SWP03999 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms