Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOEP02649 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOEP02649 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOEP02649 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOEP02649 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOEP02649 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOEP02649 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOEP02649 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOEP02649 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOEP02649 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOEP02649 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOEP02649 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOEP02649 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOEP02649 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOEP02649 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOEP02649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOEP02649 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
APOEP02649 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOEP02649 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOEP02649 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOEP02649 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOEP02649 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOEP02649 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOEP02649 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOEP02649 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOEP02649 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOEP02649 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOEP02649 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOEP02649 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOEP02649 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOEP02649 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOEP02649 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOEP02649 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOEP02649 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOEP02649 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOEP02649 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOEP02649 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
APOEP02649 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOEP02649 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOEP02649 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOEP02649 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOEP02649 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOEP02649 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APOEP02649 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOEP02649 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOEP02649 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOEP02649 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOEP02649 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOEP02649 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
APOEP02649 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOEP02649 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOEP02649 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOEP02649 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOEP02649 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOEP02649 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOEP02649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOEP02649 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOEP02649 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOEP02649 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOEP02649 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOEP02649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOEP02649 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOEP02649 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOEP02649 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOEP02649 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOEP02649 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOEP02649 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOEP02649 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOEP02649 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOEP02649 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOEP02649 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOEP02649 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOEP02649 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOEP02649 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOEP02649 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOEP02649 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APOEP02649 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOEP02649 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOEP02649 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOEP02649 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOEP02649 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOEP02649 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOEP02649 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms