Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINA1P01009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINA1P01009 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINA1P01009 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERPINA1P01009 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERPINA1P01009 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINA1P01009 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINA1P01009 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms