Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPTXRO95502 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPTXRO95502 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPTXRO95502 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NPTXRO95502 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPTXRO95502 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPTXRO95502 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms