Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGDSO95455 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGDSO95455 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGDSO95455 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGDSO95455 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGDSO95455 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGDSO95455 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGDSO95455 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGDSO95455 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGDSO95455 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGDSO95455 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGDSO95455 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGDSO95455 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGDSO95455 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGDSO95455 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGDSO95455 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGDSO95455 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGDSO95455 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGDSO95455 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGDSO95455 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGDSO95455 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGDSO95455 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGDSO95455 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGDSO95455 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGDSO95455 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGDSO95455 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGDSO95455 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGDSO95455 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGDSO95455 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGDSO95455 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGDSO95455 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGDSO95455 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGDSO95455 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TGDSO95455 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGDSO95455 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGDSO95455 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGDSO95455 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGDSO95455 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGDSO95455 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGDSO95455 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGDSO95455 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGDSO95455 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGDSO95455 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGDSO95455 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGDSO95455 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGDSO95455 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGDSO95455 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGDSO95455 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGDSO95455 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TGDSO95455 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGDSO95455 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGDSO95455 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGDSO95455 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGDSO95455 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGDSO95455 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGDSO95455 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGDSO95455 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGDSO95455 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGDSO95455 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGDSO95455 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGDSO95455 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGDSO95455 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGDSO95455 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGDSO95455 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGDSO95455 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGDSO95455 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGDSO95455 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGDSO95455 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGDSO95455 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGDSO95455 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGDSO95455 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGDSO95455 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGDSO95455 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGDSO95455 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGDSO95455 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGDSO95455 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGDSO95455 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGDSO95455 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGDSO95455 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGDSO95455 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGDSO95455 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGDSO95455 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGDSO95455 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGDSO95455 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGDSO95455 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGDSO95455 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGDSO95455 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGDSO95455 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms