Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM3O95394 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM3O95394 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM3O95394 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM3O95394 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM3O95394 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM3O95394 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM3O95394 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM3O95394 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM3O95394 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM3O95394 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM3O95394 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM3O95394 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM3O95394 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM3O95394 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM3O95394 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM3O95394 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM3O95394 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM3O95394 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM3O95394 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGM3O95394 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGM3O95394 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGM3O95394 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGM3O95394 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGM3O95394 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGM3O95394 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM3O95394 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM3O95394 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM3O95394 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM3O95394 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGM3O95394 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGM3O95394 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM3O95394 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM3O95394 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM3O95394 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGM3O95394 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGM3O95394 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM3O95394 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM3O95394 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM3O95394 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGM3O95394 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM3O95394 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM3O95394 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM3O95394 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGM3O95394 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM3O95394 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM3O95394 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM3O95394 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM3O95394 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGM3O95394 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM3O95394 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGM3O95394 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGM3O95394 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM3O95394 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGM3O95394 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM3O95394 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM3O95394 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM3O95394 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGM3O95394 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM3O95394 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGM3O95394 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGM3O95394 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGM3O95394 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM3O95394 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGM3O95394 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM3O95394 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGM3O95394 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM3O95394 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM3O95394 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGM3O95394 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGM3O95394 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGM3O95394 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGM3O95394 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGM3O95394 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGM3O95394 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM3O95394 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM3O95394 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGM3O95394 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGM3O95394 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGM3O95394 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGM3O95394 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGM3O95394 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGM3O95394 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGM3O95394 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGM3O95394 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGM3O95394 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM3O95394 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM3O95394 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGM3O95394 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGM3O95394 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGM3O95394 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms