Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB5O95377 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB5O95377 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB5O95377 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB5O95377 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB5O95377 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB5O95377 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB5O95377 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB5O95377 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB5O95377 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB5O95377 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB5O95377 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB5O95377 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB5O95377 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB5O95377 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB5O95377 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB5O95377 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB5O95377 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB5O95377 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB5O95377 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB5O95377 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB5O95377 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB5O95377 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB5O95377 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB5O95377 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB5O95377 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB5O95377 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB5O95377 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB5O95377 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB5O95377 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB5O95377 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB5O95377 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB5O95377 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB5O95377 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB5O95377 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB5O95377 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB5O95377 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB5O95377 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB5O95377 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB5O95377 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB5O95377 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB5O95377 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB5O95377 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB5O95377 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB5O95377 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB5O95377 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB5O95377 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB5O95377 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB5O95377 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB5O95377 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB5O95377 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB5O95377 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB5O95377 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB5O95377 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJB5O95377 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB5O95377 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB5O95377 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB5O95377 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB5O95377 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB5O95377 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB5O95377 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB5O95377 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB5O95377 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJB5O95377 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB5O95377 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB5O95377 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB5O95377 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB5O95377 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB5O95377 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB5O95377 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB5O95377 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB5O95377 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB5O95377 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB5O95377 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB5O95377 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB5O95377 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB5O95377 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB5O95377 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB5O95377 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB5O95377 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB5O95377 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms