Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DKK1O94907 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK1O94907 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK1O94907 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DKK1O94907 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DKK1O94907 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DKK1O94907 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DKK1O94907 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DKK1O94907 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DKK1O94907 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DKK1O94907 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DKK1O94907 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DKK1O94907 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DKK1O94907 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DKK1O94907 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DKK1O94907 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DKK1O94907 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DKK1O94907 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DKK1O94907 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DKK1O94907 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DKK1O94907 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DKK1O94907 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DKK1O94907 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DKK1O94907 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DKK1O94907 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DKK1O94907 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DKK1O94907 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DKK1O94907 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DKK1O94907 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DKK1O94907 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DKK1O94907 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DKK1O94907 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DKK1O94907 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DKK1O94907 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DKK1O94907 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DKK1O94907 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DKK1O94907 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DKK1O94907 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DKK1O94907 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DKK1O94907 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DKK1O94907 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DKK1O94907 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DKK1O94907 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DKK1O94907 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DKK1O94907 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DKK1O94907 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DKK1O94907 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DKK1O94907 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DKK1O94907 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DKK1O94907 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DKK1O94907 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DKK1O94907 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DKK1O94907 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DKK1O94907 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DKK1O94907 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DKK1O94907 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DKK1O94907 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DKK1O94907 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DKK1O94907 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DKK1O94907 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DKK1O94907 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DKK1O94907 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DKK1O94907 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DKK1O94907 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DKK1O94907 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DKK1O94907 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DKK1O94907 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DKK1O94907 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DKK1O94907 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DKK1O94907 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DKK1O94907 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DKK1O94907 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK1O94907 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK1O94907 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK1O94907 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK1O94907 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DKK1O94907 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DKK1O94907 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK1O94907 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK1O94907 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK1O94907 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK1O94907 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK1O94907 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK1O94907 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DKK1O94907 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DKK1O94907 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DKK1O94907 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DKK1O94907 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK1O94907 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK1O94907 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK1O94907 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms