Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1QL1O75973 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1QL1O75973 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QL1O75973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL1O75973 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QL1O75973 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms