Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKRAO75569 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKRAO75569 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKRAO75569 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKRAO75569 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms