Protein–RNA interactions for Protein: O75410

TACC1, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC1O75410 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TACC1O75410 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TACC1O75410 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TACC1O75410 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TACC1O75410 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TACC1O75410 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TACC1O75410 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TACC1O75410 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TACC1O75410 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TACC1O75410 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TACC1O75410 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TACC1O75410 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TACC1O75410 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TACC1O75410 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TACC1O75410 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TACC1O75410 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TACC1O75410 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TACC1O75410 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TACC1O75410 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TACC1O75410 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TACC1O75410 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms