Protein–RNA interactions for Protein: O75410

TACC1, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC1O75410 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TACC1O75410 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TACC1O75410 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TACC1O75410 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TACC1O75410 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TACC1O75410 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TACC1O75410 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TACC1O75410 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TACC1O75410 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TACC1O75410 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TACC1O75410 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TACC1O75410 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TACC1O75410 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TACC1O75410 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TACC1O75410 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TACC1O75410 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TACC1O75410 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TACC1O75410 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TACC1O75410 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TACC1O75410 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TACC1O75410 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TACC1O75410 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TACC1O75410 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TACC1O75410 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TACC1O75410 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TACC1O75410 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TACC1O75410 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TACC1O75410 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TACC1O75410 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TACC1O75410 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TACC1O75410 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TACC1O75410 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TACC1O75410 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TACC1O75410 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TACC1O75410 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TACC1O75410 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TACC1O75410 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TACC1O75410 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms