Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPFIA4O75335 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPFIA4O75335 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPFIA4O75335 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPFIA4O75335 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPFIA4O75335 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA4O75335 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms