Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN2BO60939 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN2BO60939 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN2BO60939 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN2BO60939 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN2BO60939 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms