Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPXNO60711 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPXNO60711 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPXNO60711 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPXNO60711 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LPXNO60711 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LPXNO60711 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LPXNO60711 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LPXNO60711 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LPXNO60711 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LPXNO60711 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LPXNO60711 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LPXNO60711 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPXNO60711 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPXNO60711 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LPXNO60711 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPXNO60711 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPXNO60711 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPXNO60711 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LPXNO60711 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPXNO60711 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPXNO60711 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPXNO60711 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LPXNO60711 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LPXNO60711 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPXNO60711 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPXNO60711 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPXNO60711 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LPXNO60711 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPXNO60711 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPXNO60711 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LPXNO60711 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LPXNO60711 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPXNO60711 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LPXNO60711 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LPXNO60711 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPXNO60711 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LPXNO60711 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LPXNO60711 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPXNO60711 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPXNO60711 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPXNO60711 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms