Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD2O60548 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD2O60548 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD2O60548 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD2O60548 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD2O60548 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD2O60548 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms