Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AIREO43918 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AIREO43918 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIREO43918 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AIREO43918 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIREO43918 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIREO43918 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AIREO43918 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIREO43918 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIREO43918 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AIREO43918 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIREO43918 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AIREO43918 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIREO43918 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AIREO43918 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIREO43918 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AIREO43918 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIREO43918 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AIREO43918 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIREO43918 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AIREO43918 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIREO43918 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIREO43918 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AIREO43918 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIREO43918 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIREO43918 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIREO43918 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AIREO43918 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIREO43918 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIREO43918 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AIREO43918 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIREO43918 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIREO43918 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIREO43918 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIREO43918 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AIREO43918 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIREO43918 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AIREO43918 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AIREO43918 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AIREO43918 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIREO43918 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AIREO43918 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIREO43918 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIREO43918 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIREO43918 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AIREO43918 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIREO43918 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AIREO43918 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIREO43918 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AIREO43918 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AIREO43918 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AIREO43918 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIREO43918 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIREO43918 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIREO43918 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIREO43918 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AIREO43918 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIREO43918 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIREO43918 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIREO43918 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AIREO43918 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AIREO43918 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIREO43918 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIREO43918 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIREO43918 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AIREO43918 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIREO43918 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIREO43918 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AIREO43918 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AIREO43918 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIREO43918 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIREO43918 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AIREO43918 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AIREO43918 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AIREO43918 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIREO43918 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIREO43918 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AIREO43918 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIREO43918 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIREO43918 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIREO43918 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIREO43918 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AIREO43918 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIREO43918 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIREO43918 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AIREO43918 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AIREO43918 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AIREO43918 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AIREO43918 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIREO43918 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms