Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDT21O43809 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDT21O43809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDT21O43809 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDT21O43809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUDT21O43809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDT21O43809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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