Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3IP2O43734 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP2O43734 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP2O43734 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP2O43734 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP2O43734 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP2O43734 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms