Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFB5O43674 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFB5O43674 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFB5O43674 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFB5O43674 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms