Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRY3O43610 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRY3O43610 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY3O43610 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY3O43610 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRY3O43610 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms