Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CBFA2T2O43439 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CBFA2T2O43439 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CBFA2T2O43439 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CBFA2T2O43439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CBFA2T2O43439 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBFA2T2O43439 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBFA2T2O43439 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBFA2T2O43439 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms