Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTSS1O43312 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTSS1O43312 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTSS1O43312 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTSS1O43312 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTSS1O43312 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTSS1O43312 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms