Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOCS1O15524 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS1O15524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS1O15524 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOCS1O15524 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS1O15524 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS1O15524 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOCS1O15524 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOCS1O15524 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOCS1O15524 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms