Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VILLO15195 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VILLO15195 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VILLO15195 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VILLO15195 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VILLO15195 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VILLO15195 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VILLO15195 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VILLO15195 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VILLO15195 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VILLO15195 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VILLO15195 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VILLO15195 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VILLO15195 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VILLO15195 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VILLO15195 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VILLO15195 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VILLO15195 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VILLO15195 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VILLO15195 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VILLO15195 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VILLO15195 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VILLO15195 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VILLO15195 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms