Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKO14936 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKO14936 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKO14936 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKO14936 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKO14936 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKO14936 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKO14936 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKO14936 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKO14936 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKO14936 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKO14936 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASKO14936 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASKO14936 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASKO14936 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKO14936 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKO14936 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASKO14936 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKO14936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKO14936 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKO14936 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASKO14936 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASKO14936 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKO14936 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKO14936 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKO14936 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASKO14936 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASKO14936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKO14936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKO14936 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASKO14936 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKO14936 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASKO14936 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASKO14936 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASKO14936 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASKO14936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKO14936 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKO14936 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKO14936 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASKO14936 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASKO14936 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKO14936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKO14936 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKO14936 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKO14936 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASKO14936 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKO14936 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKO14936 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASKO14936 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKO14936 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASKO14936 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKO14936 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKO14936 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASKO14936 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKO14936 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKO14936 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKO14936 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASKO14936 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASKO14936 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKO14936 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASKO14936 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASKO14936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKO14936 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASKO14936 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASKO14936 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASKO14936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKO14936 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKO14936 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKO14936 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASKO14936 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKO14936 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKO14936 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKO14936 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKO14936 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASKO14936 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms