Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE2CO00762 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2CO00762 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2CO00762 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2CO00762 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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