Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B1O00203 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B1O00203 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3B1O00203 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3B1O00203 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
AP3B1O00203 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms