Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms