Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BQF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BQF6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H3BQF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BQF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
H3BQF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BQF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BQF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BQF6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BQF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BQF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
H3BQF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H3BQF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
H3BQF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
H3BQF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
H3BQF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BQF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BQF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H3BQF6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BQF6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQF6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BQF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BQF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
H3BQF6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BQF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H3BQF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
H3BQF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
H3BQF6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H3BQF6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
H3BQF6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H3BQF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQF6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQF6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H3BQF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
H3BQF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
H3BQF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
H3BQF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQF6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQF6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27■■□□□ 1.91
H3BQF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
H3BQF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H3BQF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H3BQF6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQF6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
H3BQF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQF6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
H3BQF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
H3BQF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
H3BQF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQF6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQF6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
H3BQF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
H3BQF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
H3BQF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQF6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BQF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BQF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H3BQF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BQF6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQF6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BQF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BQF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms