Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNX1G3V0Z9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNX1G3V0Z9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYNX1G3V0Z9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYNX1G3V0Z9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNX1G3V0Z9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNX1G3V0Z9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNX1G3V0Z9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNX1G3V0Z9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms