Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN25C9JDP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN25C9JDP6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN25C9JDP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN25C9JDP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN25C9JDP6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN25C9JDP6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms